祭场阿苏神社所奉祀的主祭神是健磐龙命。
根据传说，神武天皇七十六年春二月卯日，健磐龙命由山城国前往阿苏国，而后迎娶日子八井命的女儿・阿苏都媛，被奉祀为阿苏当地的神祇。