這是祭祀神武天皇（初代天皇）的第一皇子，也是草部神話主角的日子八井命等12位神明，與開拓阿蘇有所淵源的神社。

據說日子八井命在神武69年8月5日受到皇命，而從日向國高千穗之峰來到草部之鄉，討伐了一直以來威脅居民安全的大蛇之後，便定居於大蛇曾居住的「吉之池」。
這時祂將「吉之池」掩埋起來，立起宮柱，用草覆蓋上屋頂和牆壁，稱之為「草壁」，而後更名為今日所稱的「草部」。

這裡的社殿位置比鳥居還要低，是非常稀有少見，稱為「下宮」的配置。草部吉見神社，鵜戶神社（宮崎縣日南市）與貫前神社（群馬縣富岡市）則是日本三大下宮神社。

以日本三大下宮之一而知名的草部吉見神社，從130階的階梯向下走之後，可以看到社殿。社殿後方的崖下有一座推定樹齡500～600年的大樹（大杉木）。
草部吉見神社神木的大杉，是樹幹一圈長達7.7公尺，高度40公尺的大樹，充滿了神聖莊嚴的氛圍。

例行祭典有7月31日和10月17日的夏，秋季2次。7月31日時到地引原的茶屋會有神轎的展出，並在神殿前的神樂殿進行岩戶系的神樂三十三座奉納。10月17日時則在神殿旁的廣場，進行大神御手相撲的奉納。